Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 snR41snR41 95 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 DIA2YOR080W 2199 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 BMH2YDR099W 822 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RPI1YIL119C 1224 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YLR230WYLR230W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YLR302CYLR302C 363 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RPL19BYBL027W 570 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 DDR48YMR173W 1293 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 IGO1YNL157W 507 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 DUF1YOL087C 3351 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 OST2YOR103C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YPR014CYPR014C 330 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 BUD4YJR092W 4344 nt2.72□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YKL222CYKL222C 2118 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MUD2YKL074C 1584 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MCR1YKL150W 909 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 PAU23YLR037C 375 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 VAC8YEL013W 1737 nt2.71□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 DBP7YKR024C 2229 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 TFC4YGR047C 3078 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YDR114CYDR114C 303 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 PAU10YDR542W 363 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 GET1YGL020C 708 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 PAU11YGL261C 363 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MRP49YKL167C 414 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 AIM29YKR074W 468 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 CDC123YLR215C 1083 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ARV1YLR242C 966 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 PAU4YLR461W 363 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 SAS2YMR127C 1017 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 HHT2YNL031C 411 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YNR021WYNR021W 1215 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YPL034WYPL034W 498 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 RRD2YPL152W 1077 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 IRC16YPR038W 360 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 BIT61YJL058C 1632 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ITC1YGL133W 3795 nt2.7□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 RIF1YBR275C 5751 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 RMT2YDR465C 1239 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YKL063CYKL063C 504 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 SEN15YMR059W 387 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 snR42snR42 351 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 TFB1YDR311W 1929 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 HEH2YDR458C 1992 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 INP52YNL106C 3552 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ATP22YDR350C 2055 nt2.69□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 SPE1YKL184W 1401 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 NTO1YPR031W 2247 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YOR296WYOR296W 3870 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 TRZ1YKR079C 2517 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 AGA2YGL032C 264 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ERV1YGR029W 570 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 BIG1YHR101C 1008 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YAL037WYAL037W 804 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 LSM2YBL026W 288 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YNL043CYNL043C 321 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 snR191snR191 274 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 BNA4YBL098W 1383 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ESL1YIL151C 3357 nt2.68□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 PFF1YBR074W 2931 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MET5YJR137C 4329 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MSB2YGR014W 3921 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 RTR2YDR066C 591 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YDR157WYDR157W 402 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ERG28YER044C 447 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 ECL1YGR146C 636 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YHL005CYHL005C 393 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 COX23YHR116W 456 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 SPC1YJR010C-A 285 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YML108WYML108W 318 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YOL150CYOL150C 312 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 FYV12YOR183W 390 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YPR012WYPR012W 255 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YBR209WYBR209W 318 nt2.67□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 SPO23YBR250W 1572 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 MES1YGR264C 2256 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 HUR1YGL168W 333 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 BET3YKR068C 582 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 PKR1YMR123W 369 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 YKR078WYKR078W 1758 nt2.66□□□□□ -1.98
SSK1Q07084 BFR1YOR198C 1413 nt2.66□□□□□ -1.98
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