Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSME1Q06323 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PSME1Q06323 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms