Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ATP7AQ04656 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms