Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN2Q02246 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms