Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sh3bp1P55194 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Sh3bp1P55194 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Sh3bp1P55194 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp1P55194 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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