Protein–RNA interactions for Protein: P38235

YBR053C, Uncharacterized protein YBR053C, yeast

Predictions only

Length 358 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBR053C	P38235	VEL1	YGL258W	621 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	PEX17	YNL214W	600 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	MRPL50	YNR022C	420 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	HSP10	YOR020C	321 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	CWH41	YGL027C	2502 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.41	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	SRB4	YER022W	2064 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	NIC96	YFR002W	2520 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	XRS2	YDR369C	2565 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.4	□□□□□ -1.86
YBR053C	P38235	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YDL068W	YDL068W	330 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RNR4	YGR180C	1038 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YAR029W	YAR029W	225 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	UBC7	YMR022W	498 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	GOT1	YMR292W	417 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RPL18A	YOL120C	561 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YPL039W	YPL039W	951 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YPL142C	YPL142C	318 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	GSC2	YGR032W	5688 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YLR001C	YLR001C	2589 nt		3.4	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	AAD16	YFL057C	459 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	AIM32	YML050W	936 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YNL179C	YNL179C	438 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	MAK5	YBR142W	2322 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	MPS1	YDL028C	2295 nt		3.39	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YJR003C	YJR003C	1560 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YCR081C-A	YCR081C-A	237 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	PEX4	YGR133W	552 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	SIP18	YMR175W	240 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	HHT2	YNL031C	411 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	SSP1	YHR184W	1716 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	IMD4	YML056C	1575 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.38	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	REC8	YPR007C	2043 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	PRP22	YER013W	3438 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	tC(GCA)B	tC(GCA)B	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	tC(GCA)G	tC(GCA)G	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	tC(GCA)P1	tC(GCA)P1	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	tC(GCA)P2	tC(GCA)P2	72 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RRT13	YER066W	558 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RPS26B	YER131W	360 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	ANB1	YJR047C	474 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	ADI1	YMR009W	540 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.37	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YEL057C	YEL057C	702 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YGR025W	YGR025W	303 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	COX23	YHR116W	456 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	SHH3	YMR118C	591 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	snR13	snR13	124 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YPL080C	YPL080C	327 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	MED1	YPR070W	1701 nt		3.36	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RED1	YLR263W	2484 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	MKT1	YNL085W	2493 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	DIE2	YGR227W	1578 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	Q0032	Q0032	291 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RTT105	YER104W	627 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YHR214W-A	YHR214W-A	486 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YAR068W	YAR068W	486 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YMR320W	YMR320W	306 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YBL108W	YBL108W	306 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YOR146W	YOR146W	306 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	ATP3	YBR039W	936 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	VID27	YNL212W	2349 nt		3.35	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	RAD26	YJR035W	3258 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YFL032W	YFL032W	321 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YGR073C	YGR073C	372 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	LSM2	YBL026W	288 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	BIL1	YOR304C-A	231 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	DGK1	YOR311C	873 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YBR053C	P38235	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.34	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	URA2	YJL130C	6645 nt		3.34	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YKL050C	YKL050C	2769 nt		3.34	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	CBP2	YHL038C	1893 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	NOP4	YPL043W	2058 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	PFY1	YOR122C	381 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	KIN82	YCR091W	2163 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YRM1	YOR172W	2361 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	STU2	YLR045C	2667 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	ALY1	YKR021W	2748 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	YDR102C	YDR102C	333 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YBR053C	P38235	SPG3	YDR504C	384 nt		3.32	□□□□□ -1.88

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