Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COPB2P35606 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB2P35606 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB2P35606 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB2P35606 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COPB2P35606 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COPB2P35606 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COPB2P35606 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COPB2P35606 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COPB2P35606 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms