Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD4P01730 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD4P01730 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD4P01730 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD4P01730 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD4P01730 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD4P01730 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD4P01730 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD4P01730 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD4P01730 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms