Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX58O95786 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX58O95786 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX58O95786 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DDX58O95786 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX58O95786 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms