Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLGNO14967 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLGNO14967 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLGNO14967 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLGNO14967 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLGNO14967 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CLGNO14967 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CLGNO14967 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CLGNO14967 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms