Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMKR1H3BMG3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMKR1H3BMG3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms