Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1iE9Q7P2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1iE9Q7P2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms