Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POTEMA6NI47 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POTEMA6NI47 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms