Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHORDC1Q9UHD1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHORDC1Q9UHD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms