Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CACNG4Q9UBN1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG4Q9UBN1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms