Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GGA3Q9NZ52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms