Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MIS18AQ9NYP9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MIS18AQ9NYP9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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