Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELL3Q9HB65 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms