Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms