Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sft2d3Q9CSV6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms