Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCO2Q9BYV7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BCO2Q9BYV7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms