Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms