Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC10A4Q96EP9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC10A4Q96EP9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms