Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
NXPE2Q96DL1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NXPE2Q96DL1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms