Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC47Q96A33 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC47Q96A33 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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