Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BEST2Q8NFU1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEST2Q8NFU1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms