Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMG8Q8ND04 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms