Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC171Q6TFL3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC171Q6TFL3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms