Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LETMD1Q6P1Q0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms