Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CHRNA2Q15822 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms