Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNHIT3Q15649 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ZNHIT3Q15649 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms