Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YER053C-AYER053C-A 114 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 HSP12YFL014W 330 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 TAH11YJR046W 1815 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 SKM1YOL113W 1968 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 ERG7YHR072W 2196 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 LCD1YDR499W 2244 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YPR204WYPR204W 3099 nt5.36□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 TSL1YML100W 3297 nt5.35□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YSH1YLR277C 2340 nt5.35□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 PGM2YMR105C 1710 nt5.35□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YEL045CYEL045C 426 nt5.35□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 PRO3YER023W 861 nt5.35□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 IPT1YDR072C 1584 nt5.34□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 YLL067CYLL067C 3618 nt5.34□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 SPC97YHR172W 2472 nt5.34□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 PEX6YNL329C 3093 nt5.34□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 TMA19YKL056C 504 nt5.34□□□□□ -1.55
WSC3Q12215 JHD2YJR119C 2187 nt5.33□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 PRP43YGL120C 2304 nt5.33□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 NPC2YDL046W 522 nt5.33□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 RPS16BYDL083C 432 nt5.33□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 STT3YGL022W 2157 nt5.33□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 PAN3YKL025C 2040 nt5.33□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 YDR230WYDR230W 348 nt5.32□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 YER121WYER121W 345 nt5.32□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 snR35snR35 204 nt5.32□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 CDC45YLR103C 1953 nt5.32□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 VHT1YGR065C 1782 nt5.32□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 SKN1YGR143W 2316 nt5.31□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.31□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 YOR102WYOR102W 351 nt5.31□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 FRS1YLR060W 1788 nt5.31□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 YOL153CYOL153C 1746 nt5.31□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 ATP1YBL099W 1638 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 SPB1YCL054W 2526 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 DPB11YJL090C 2295 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 FPK1YNR047W 2682 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 GEP4YHR100C 558 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 FRE4YNR060W 2160 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 YGR054WYGR054W 1929 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 NHA1YLR138W 2958 nt5.3□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 VNX1YNL321W 2727 nt5.28□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 GEF1YJR040W 2340 nt5.28□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 snR74snR74 88 nt5.28□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 SAC6YDR129C 1929 nt5.28□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 FKH2YNL068C 2589 nt5.28□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 CSC1YLR241W 2349 nt5.28□□□□□ -1.56
WSC3Q12215 MAK31YCR020C-A 267 nt5.27□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 VAM7YGL212W 951 nt5.27□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 PGM1YKL127W 1713 nt5.27□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 RPL33AYPL143W 324 nt5.27□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 POL12YBL035C 2118 nt5.27□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 OXP1YKL215C 3861 nt5.26□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 YKL222CYKL222C 2118 nt5.26□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 ZRG17YNR039C 1818 nt5.26□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt5.26□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 ACM1YPL267W 630 nt5.26□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 PPR1YLR014C 2715 nt5.26□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 SLX4YLR135W 2247 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 ECM22YLR228C 2445 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 NHX1YDR456W 1902 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 RGD1YBR260C 2001 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 QNS1YHR074W 2145 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 YNL285WYNL285W 372 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 YML133CYML133C 4125 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 YEL1YBL060W 2064 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 FLC3YGL139W 2409 nt5.25□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 SUL2YLR092W 2682 nt5.24□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 STE13YOR219C 2796 nt5.24□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 DLS1YJL065C 504 nt5.24□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 YNR042WYNR042W 429 nt5.24□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 DFG16YOR030W 1860 nt5.24□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 HUL5YGL141W 2733 nt5.24□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt5.23□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 GIS2YNL255C 462 nt5.23□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 RPS7AYOR096W 573 nt5.23□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 THI7YLR237W 1797 nt5.22□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 FYV10YIL097W 1551 nt5.22□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 ATP7YKL016C 525 nt5.22□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 STB2YMR053C 2553 nt5.22□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 PSP1YDR505C 2526 nt5.22□□□□□ -1.57
WSC3Q12215 PEX5YDR244W 1839 nt5.21□□□□□ -1.58
WSC3Q12215 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.21□□□□□ -1.58
WSC3Q12215 YGR176WYGR176W 348 nt5.21□□□□□ -1.58
WSC3Q12215 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt5.21□□□□□ -1.58
WSC3Q12215 TFC8YPL007C 1767 nt5.21□□□□□ -1.58
WSC3Q12215 PAT1YCR077C 2391 nt5.21□□□□□ -1.58
WSC3Q12215 MUK1YPL070W 1839 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms