Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 RSR1YGR152C 819 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 TPK3YKL166C 1197 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 YMR181CYMR181C 465 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 NGL1YOL042W 1092 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 IPP1YBR011C 864 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 ARK1YNL020C 1917 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 AFI1YOR129C 2682 nt2.28□□□□□ -2.04
VIK1Q12045 RGA1YOR127W 3024 nt2.28□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ROY1YMR258C 1662 nt2.28□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 BIT61YJL058C 1632 nt2.28□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 PHO91YNR013C 2685 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 RAD18YCR066W 1464 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YDR262WYDR262W 819 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YIL012WYIL012W 342 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ISU1YPL135W 498 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 FUS2YMR232W 2034 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 TFB1YDR311W 1929 nt2.27□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ESC2YDR363W 1371 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SIP3YNL257C 3690 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SLK19YOR195W 2466 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SLU7YDR088C 1149 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 PCL5YHR071W 690 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 AYR1YIL124W 894 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 UTP30YKR060W 825 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YLL044WYLL044W 447 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 AIM36YMR157C 768 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 RXT2YBR095C 1293 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SEC66YBR171W 621 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 MED8YBR193C 672 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 STH1YIL126W 4080 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YLR108CYLR108C 1458 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 JJJ2YJL162C 1752 nt2.26□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 Q0255Q0255 1419 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 MAL33YBR297W 1407 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ASI3YNL008C 2031 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 KSP1YHR082C 3090 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 KEI1YDR367W 666 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 STE2YFL026W 1296 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YNL319WYNL319W 441 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ARL1YBR164C 552 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 MBA1YBR185C 837 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SAP185YJL098W 3177 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SEC16YPL085W 6588 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 AGE1YDR524C 1449 nt2.25□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YNL018CYNL018C 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ERG28YER044C 447 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 UBP2YOR124C 3819 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SME1YOR159C 285 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 GRX5YPL059W 453 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SGS1YMR190C 4344 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 RGL1YPL066W 1440 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SRB4YER022W 2064 nt2.24□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 VPS38YLR360W 1320 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 LST4YKL176C 2487 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YGR050CYGR050C 357 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 NOP19YGR251W 591 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SUI2YJR007W 915 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YJR020WYJR020W 333 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 PAU23YLR037C 375 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YLR217WYLR217W 324 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 ECI1YLR284C 843 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YOL107WYOL107W 1029 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 RPS12YOR369C 432 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YPL276WYPL276W 438 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 STI1YOR027W 1770 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 MSB1YOR188W 3414 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 UBX3YDL091C 1368 nt2.23□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 OSW7YFR039C 1533 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YCR090CYCR090C 549 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YDR193WYDR193W 399 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 FPR1YNL135C 345 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 HEM4YOR278W 828 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 YOR331CYOR331C 558 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 snR191snR191 274 nt2.22□□□□□ -2.05
VIK1Q12045 SPP41YDR464W 4308 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 TIF35YDR429C 825 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 MIC19YFR011C 513 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 GPI14YJR013W 1212 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 CAP1YKL007W 807 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 COA4YLR218C 453 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 BRX1YOL077C 876 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 YBR051WYBR051W 351 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 SLM4YBR077C 489 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 HSC82YMR186W 2118 nt2.21□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 YLR446WYLR446W 1302 nt2.2□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 APC11YDL008W 498 nt2.2□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 RSM28YDR494W 1086 nt2.2□□□□□ -2.06
VIK1Q12045 LOC1YFR001W 615 nt2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms