Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFF3Q07654 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms