Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 GPI15YNL038W 690 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YNL324WYNL324W 396 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SVS1YPL163C 783 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 GDI1YER136W 1356 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 GCD6YDR211W 2139 nt2.81□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 MSH2YOL090W 2895 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SPO13YHR014W 876 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 RPS21BYJL136C 264 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 LSM8YJR022W 330 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 ILV5YLR355C 1188 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 PBI2YNL015W 228 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 TOM22YNL131W 459 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 PBS2YJL128C 2007 nt2.8□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 JJJ2YJL162C 1752 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 CCT7YJL111W 1653 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SRC1YML034W 2505 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 TAO3YIL129C 7131 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SSF1YHR066W 1362 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 VPS3YDR495C 3036 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 HNT1YDL125C 477 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YGL015CYGL015C 393 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YGL042CYGL042C 306 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 Q0142Q0142 177 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YAP3YHL009C 993 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YLR171WYLR171W 390 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 RPL20BYOR312C 519 nt2.79□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 NOP4YPL043W 2058 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SNQ2YDR011W 4506 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 MIX14YDR031W 366 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 BNA7YDR428C 786 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 YHR130CYHR130C 336 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 DAD2YKR083C 402 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SSN8YNL025C 972 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 TIM12YBR091C 330 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SLP1YOR154W 1764 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 GDS1YOR355W 1569 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 SEC7YDR170C 6030 nt2.78□□□□□ -1.96
SSK1Q07084 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YEL1YBL060W 2064 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 BI2Q0110 1272 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 DFG10YIL049W 762 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 SDP1YIL113W 630 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RRT16YNL105W 429 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RIO2YNL207W 1278 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 NGL1YOL042W 1092 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 PRM3YPL192C 402 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YPR050CYPR050C 414 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 AKR1YDR264C 2295 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 BI4Q0120 1917 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RSN1YMR266W 2862 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 SPP382YLR424W 2127 nt2.77□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 AVT2YEL064C 1443 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 ROM1YGR070W 3468 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 ARK1YNL020C 1917 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 EPL1YFL024C 2499 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 VAS1YGR094W 3315 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 snR56snR56 88 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YIL012WYIL012W 342 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 MRPL38YKL170W 417 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 CTK3YML112W 891 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YNL179CYNL179C 438 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RRG8YPR116W 834 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 UBP14YBR058C 2346 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 MYO5YMR109W 3660 nt2.76□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YCK2YNL154C 1641 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 SLH1YGR271W 5904 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YDL032WYDL032W 312 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 OTU2YHL013C 924 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YLR297WYLR297W 390 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 MDV1YJL112W 2145 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 ALY1YKR021W 2748 nt2.75□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 STE6YKL209C 3873 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 PMR1YGL167C 2853 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 VPS30YPL120W 1674 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RPS26BYER131W 360 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 SDH3YKL141W 597 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 FAA2YER015W 2235 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 ATG13YPR185W 2217 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 CEP3YMR168C 1827 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 KAP104YBR017C 2757 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 MOT1YPL082C 5604 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 SSF2YDR312W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 ICR1ICR1 3199 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 NMD2YHR077C 3270 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 TSC11YER093C 4293 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 YHC1YLR298C 696 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 HRI1YLR301W 735 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 HEM4YOR278W 828 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 RSA1YPL193W 1146 nt2.73□□□□□ -1.97
SSK1Q07084 SWD3YBR175W 948 nt2.73□□□□□ -1.97
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