Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNB1P98172 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms