Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CRB1P82279 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRB1P82279 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRB1P82279 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CRB1P82279 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms