Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcd1P48410 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcd1P48410 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms