Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GRIA4P48058 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIA4P48058 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms