Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATRXP46100 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATRXP46100 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRXP46100 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATRXP46100 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATRXP46100 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATRXP46100 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATRXP46100 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms