Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fen1P39749 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fen1P39749 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fen1P39749 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms