Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM23P36406 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms