Protein–RNA interactions for Protein: P34223

SHP1, UBX domain-containing protein 1, yeast

Predictions only

Length 423 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	P34223	EMC6	YLL014W	327 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	GAL80	YML051W	1308 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	EAP1	YKL204W	1899 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	OSW7	YFR039C	1533 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SRB4	YER022W	2064 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	URB2	YJR041C	3525 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	UBP14	YBR058C	2346 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	ATG13	YPR185W	2217 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SCY1	YGL083W	2415 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	FKS3	YMR306W	5358 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	PRE4	YFR050C	801 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SCEI	Q0160	708 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YJL086C	YJL086C	369 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	ENV10	YLR065C	546 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SWS2	YNL081C	432 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	PIS1	YPR113W	663 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	AFR1	YDR085C	1863 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	MAL33	YBR297W	1407 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SIN3	YOL004W	4611 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	RPS21B	YJL136C	264 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YLR224W	YLR224W	1110 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	COX8	YLR395C	237 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	PDP3	YLR455W	915 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YLR456W	YLR456W	615 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	TRS20	YBR254C	528 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	JJJ2	YJL162C	1752 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	BUD4	YJR092W	4344 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SHE4	YOR035C	2370 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	TCB2	YNL087W	3537 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	FIN1	YDR130C	876 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	ILM1	YJR118C	612 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	CSE4	YKL049C	690 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YKL066W	YKL066W	444 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SKO1	YNL167C	1944 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	CCT7	YJL111W	1653 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	AVT2	YEL064C	1443 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	DIA2	YOR080W	2199 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	LCB4	YOR171C	1875 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	AXL1	YPR122W	3627 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YCR090C	YCR090C	549 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	MTC7	YEL033W	420 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	YGL159W	YGL159W	1113 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	JID1	YPR061C	906 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	SWD3	YBR175W	948 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SHP1	P34223	NMA111	YNL123W	2994 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	MET5	YJR137C	4329 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	HAA1	YPR008W	2085 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	VPS74	YDR372C	1038 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	MPO1	YGL010W	525 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	BET4	YJL031C	984 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	CPR7	YJR032W	1182 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YKR051W	YKR051W	1257 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YNL203C	YNL203C	612 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YOL013W-B	YOL013W-B	291 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	NGL1	YOL042W	1092 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	SFM1	YOR021C	642 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	BUD21	YOR078W	645 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	ARK1	YNL020C	1917 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	SSP1	YHR184W	1716 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	VTC3	YPL019C	2508 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YIL029C	YIL029C	429 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	PSY1	YKL076C	384 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	CCW14	YLR390W-A	717 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	UBX4	YMR067C	1251 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	SHE9	YDR393W	1371 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	DBF20	YPR111W	1695 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	PTP3	YER075C	2787 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YDR537C	YDR537C	606 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YIL012W	YIL012W	342 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	TAP42	YMR028W	1101 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YMR181C	YMR181C	465 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	RRT16	YNL105W	429 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YOR169C	YOR169C	465 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	RRD2	YPL152W	1077 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	CDH1	YGL003C	1701 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	ATP22	YDR350C	2055 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	IRC2	YDR112W	309 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	CHZ1	YER030W	462 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YGR290W	YGR290W	444 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	PAU14	YIL176C	363 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	PAU1	YJL223C	363 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	MCR1	YKL150W	909 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YRR1	YOR162C	2433 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	BIT61	YJL058C	1632 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YER175W-A	YER175W-A	165 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SHP1	P34223	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		2.79	□□□□□ -1.96

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