Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TM4SF1P30408 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF1P30408 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms