Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFX1P22670 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFX1P22670 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFX1P22670 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFX1P22670 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFX1P22670 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFX1P22670 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFX1P22670 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms