Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A3P13637 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A3P13637 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms