Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRF1P10914 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IRF1P10914 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IRF1P10914 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IRF1P10914 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms