Protein–RNA interactions for Protein: P0CX28

RPL42B, 60S ribosomal protein L42-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL42BP0CX28 KHA1YJL094C 2622 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 STP2YHR006W 1626 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 FRT2YAL028W 1587 nt2.78□□□□□ -1.96
RPL42BP0CX28 TAF1YGR274C 3201 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YDR431WYDR431W 312 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 VOA1YGR106C 798 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 BCD1YHR040W 1101 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 SRL3YKR091W 741 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 HHT2YNL031C 411 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YPL080CYPL080C 327 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YPR059CYPR059C 387 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 CHS3YBR023C 3498 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 SLP1YOR154W 1764 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 ALY1YKR021W 2748 nt2.77□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 PRP22YER013W 3438 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 NSP1YJL041W 2472 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 TAF6YGL112C 1551 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 VFA1YER128W 612 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 TEN1YLR010C 483 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YLR230WYLR230W 306 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 CDC33YOL139C 642 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 PEX11YOL147C 711 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 TSC3YBR058C-A 243 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YLR001CYLR001C 2589 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 MSD1YPL104W 1977 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 CHA4YLR098C 1947 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 GYL1YMR192W 2163 nt2.76□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YPR022CYPR022C 3402 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 PHO81YGR233C 3537 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RDS1YCR106W 2499 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 CDC45YLR103C 1953 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YDR090CYDR090C 933 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YFL065CYFL065C 309 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YGL165CYGL165C 579 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RPS1AYLR441C 768 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 TVP18YMR071C 504 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RRP5YMR229C 5190 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 ALA1YOR335C 2877 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RNH70YGR276C 1662 nt2.75□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 ARO1YDR127W 4767 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 SEC15YGL233W 2733 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 SKN7YHR206W 1869 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 TMA17YDL110C 453 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 SDH7YDR511W 402 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 LAG1YHL003C 1236 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 UTP11YKL099C 753 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 PEX17YNL214W 600 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RPL23AYBL087C 414 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 ERP4YOR016C 624 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 PFY1YOR122C 381 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YPL039WYPL039W 951 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 ROD1YOR018W 2514 nt2.74□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 GNT1YOR320C 1476 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RPL29YFR032C-A 180 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YKL136WYKL136W 399 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YAR070CYAR070C 300 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 SHH3YMR118C 591 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RIM11YMR139W 1113 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YMR141CYMR141C 309 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YNL057WYNL057W 333 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RSM19YNR037C 276 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YOL150CYOL150C 312 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YBR137WYBR137W 540 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 MSL5YLR116W 1431 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 BFR1YOR198C 1413 nt2.73□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 FAA2YER015W 2235 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YCG1YDR325W 3108 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 FAP7YDL166C 594 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RPL27BYDR471W 411 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RPB9YGL070C 369 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 RPS23BYPR132W 438 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 ARK1YNL020C 1917 nt2.72□□□□□ -1.97
RPL42BP0CX28 YGR035CYGR035C 351 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 RNR4YGR180C 1038 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 RPS24BYIL069C 408 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 LSM1YJL124C 519 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 YJR079WYJR079W 330 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 YLR434CYLR434C 384 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 SIP18YMR175W 240 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 ZEO1YOL109W 342 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 ROY1YMR258C 1662 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 AUS1YOR011W 4185 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 KIN82YCR091W 2163 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 MTR4YJL050W 3222 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 REG1YDR028C 3045 nt2.71□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 BYE1YKL005C 1785 nt2.7□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 RRT13YER066W 558 nt2.7□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 YER181CYER181C 324 nt2.7□□□□□ -1.98
RPL42BP0CX28 RAD6YGL058W 519 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.7 ms