Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSDE1O75534 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSDE1O75534 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms