Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITX3O75364 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms